MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 1844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	TGT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973608
2	NC_009650	GGC	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973608
3	NC_009650	T	6	6	635	640	0 %	100 %	0 %	0 %	152973609
4	NC_009650	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973609
5	NC_009650	TTC	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973609
6	NC_009650	TCA	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
7	NC_009650	CAG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973609
8	NC_009650	CGT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973609
9	NC_009650	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
10	NC_009650	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973609
11	NC_009650	CAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
12	NC_009650	TTC	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973609
13	NC_009650	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973609
14	NC_009650	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973610
15	NC_009650	TGG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
16	NC_009650	TGG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
17	NC_009650	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
18	NC_009650	CAA	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973610
19	NC_009650	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973610
20	NC_009650	ATC	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
21	NC_009650	TAA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
22	NC_009650	TAC	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
23	NC_009650	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
24	NC_009650	CAG	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
25	NC_009650	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
26	NC_009650	CTG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
27	NC_009650	CTG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
28	NC_009650	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
29	NC_009650	TAA	2	6	2043	2048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
30	NC_009650	CTG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
31	NC_009650	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973610
32	NC_009650	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	152973610
33	NC_009650	GCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
34	NC_009650	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
35	NC_009650	ATG	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973610
36	NC_009650	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
37	NC_009650	TGC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
38	NC_009650	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
39	NC_009650	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
40	NC_009650	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
41	NC_009650	AGC	3	9	2523	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
42	NC_009650	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
43	NC_009650	A	8	8	2546	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	152973610
44	NC_009650	GCA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
45	NC_009650	GAG	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
46	NC_009650	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973610
47	NC_009650	TGC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
48	NC_009650	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
49	NC_009650	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
50	NC_009650	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973610
51	NC_009650	AGC	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
52	NC_009650	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973610
53	NC_009650	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973610
54	NC_009650	G	8	8	3450	3457	0 %	0 %	100 %	0 %	152973610
55	NC_009650	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973610
56	NC_009650	TTC	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973610
57	NC_009650	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
58	NC_009650	AGG	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
59	NC_009650	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973610
60	NC_009650	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973611
61	NC_009650	GAA	3	9	3818	3826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973611
62	NC_009650	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
63	NC_009650	GAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973611
64	NC_009650	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973611
65	NC_009650	CTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
66	NC_009650	TTC	2	6	3967	3972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973611
67	NC_009650	GCT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
68	NC_009650	TGA	2	6	4064	4069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973611
69	NC_009650	A	7	7	4329	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	152973612
70	NC_009650	TGT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973612
71	NC_009650	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973612
72	NC_009650	GCC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973612
73	NC_009650	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973612
74	NC_009650	GCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973612
75	NC_009650	GCG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973612
76	NC_009650	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973612
77	NC_009650	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973612
78	NC_009650	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973612
79	NC_009650	TCT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973612
80	NC_009650	TCA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973612
81	NC_009650	CGC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973612
82	NC_009650	GAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973612
83	NC_009650	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973612
84	NC_009650	TTA	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973612
85	NC_009650	CAG	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973613
86	NC_009650	TGC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973613
87	NC_009650	AAG	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973613
88	NC_009650	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973613
89	NC_009650	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973613
90	NC_009650	CTC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973613
91	NC_009650	CGC	2	6	5830	5835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973614
92	NC_009650	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973614
93	NC_009650	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973614
94	NC_009650	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973614
95	NC_009650	TGG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973614
96	NC_009650	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
97	NC_009650	CGG	2	6	6438	6443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973614
98	NC_009650	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
99	NC_009650	AAG	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973614
100	NC_009650	TGC	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973614
101	NC_009650	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
102	NC_009650	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973614
103	NC_009650	T	6	6	7677	7682	0 %	100 %	0 %	0 %	152973615
104	NC_009650	CCAAA	2	10	7693	7702	60 %	0 %	0 %	40 %	152973615
105	NC_009650	CTT	2	6	7776	7781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973615
106	NC_009650	TC	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	152973615
107	NC_009650	T	6	6	7923	7928	0 %	100 %	0 %	0 %	152973615
108	NC_009650	AAT	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973615
109	NC_009650	CAT	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973616
110	NC_009650	GGA	2	6	8223	8228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973616
111	NC_009650	GCT	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973616
112	NC_009650	CG	4	8	8341	8348	0 %	0 %	50 %	50 %	152973616
113	NC_009650	GCT	2	6	8369	8374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973616
114	NC_009650	GGT	2	6	8399	8404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973616
115	NC_009650	TGG	2	6	8420	8425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973616
116	NC_009650	AAC	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973616
117	NC_009650	A	6	6	8529	8534	100 %	0 %	0 %	0 %	152973617
118	NC_009650	CT	3	6	8597	8602	0 %	50 %	0 %	50 %	152973617
119	NC_009650	GCA	2	6	8642	8647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973617
120	NC_009650	CG	3	6	8667	8672	0 %	0 %	50 %	50 %	152973617
121	NC_009650	GGT	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973617
122	NC_009650	GCG	2	6	8772	8777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973617
123	NC_009650	GAC	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973617
124	NC_009650	TGGC	2	8	9037	9044	0 %	25 %	50 %	25 %	152973617
125	NC_009650	CCA	2	6	9076	9081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973617
126	NC_009650	TCAG	2	8	9152	9159	25 %	25 %	25 %	25 %	152973618
127	NC_009650	GCA	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973618
128	NC_009650	ATA	2	6	9327	9332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973619
129	NC_009650	GGCCT	2	10	9342	9351	0 %	20 %	40 %	40 %	152973619
130	NC_009650	TGG	2	6	9386	9391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973619
131	NC_009650	GTT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973619
132	NC_009650	GAGCA	2	10	9531	9540	40 %	0 %	40 %	20 %	152973619
133	NC_009650	GC	3	6	9542	9547	0 %	0 %	50 %	50 %	152973619
134	NC_009650	GGCG	2	8	9555	9562	0 %	0 %	75 %	25 %	152973619
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261	NC_009650	ATC	2	6	16093	16098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973626
262	NC_009650	TCA	2	6	16133	16138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973626
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264	NC_009650	GA	3	6	16191	16196	50 %	0 %	50 %	0 %	152973626
265	NC_009650	TCA	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973626
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269	NC_009650	GTA	2	6	16452	16457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973626
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387	NC_009650	TCA	2	6	24523	24528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973633
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500	NC_009650	TGCC	2	8	29434	29441	0 %	25 %	25 %	50 %	152973641

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